Birlik Başkanı ise sürekli il dışında olması, Birliğin iyi yönetilmediği gibi sahipsiz kaldığı da ileri sürülmektedir. Ardahan Damızlık Koyun Keçi Yetiştiricileri Birliğinde yaşanan sıkıntılar nedeniyle bazı üyelerin Bakanlık başta olmak üzere Ardahan Cumhuriyet Başsavcılığına ve Ardahan Gıda Tarım ve Hayvancılık İl Müdürlüğüne şikayetlerin olduğu öğrenilirken, yaşanan bu şikayetler üzerine Bakanlık tarafından gönderilen müfettişlerin yaptıkları inceleme sonucunda Ardahan Damızlık Koyun Keçi Yetiştiricileri Birliği'nin yasalara uygun bir seçim yapmadığı ileri sürülürken, Birliğin yeniden seçime gitme kararı aldığı iddia edildi!
Ardahan Damızlık Koyun Keçi Yetiştiricileri Birliği'nin 2011'de yaptığı olağan genel kurul seçiminde üyelere bildiri yapmadığı iddia edilirken, üyenin en çok bulunduğu Çıldır ilçesinde ise hiçbir üyeye bu seçim ile ilgili bildiri gönderilmediği de alınan bilgiler arasında oldu!
Yaklaşık 180 üyesi bulunan Ardahan Damızlık Koyun Keçi Yetiştiricileri Birliği, üyelerine bakanlık tarafından tahsis edilen desteklemelerde şeffaf bir yönetim ortaya koymadığı ileri sürülürken, Birliğin başında bulunan yönetimin ise yasalara uygun seçim yapmadığı ve Birliğin hesabını amacı dışında kullandığı iddia edilmektedir.
Yine Bakanlık tarafından üyelerine vermesi gereken desteklemelerde Koyun-Keçi başına 15 TL desteğin %25'ni Birliğe gelir olarak aktardığı, Birliğin ciddi bir borç yükü altında olduğu, Ardahan Damızlık Koyun Keçi Yetiştiricileri Birliği'nin yönetiminde ise, yönetici şartlarını taşıyan kişilerden oluşmadığı da gelen iddialar arasında!
